Несмотря на географический близость к Чезене, Лонджано всегда тяготел к орбите Римини. С 1295 по 1463 год деревня принадлежала семейству Малатеста.
Чезенаты и риминэзи на протяжении веков оспаривали господство над этой территорией, но люди Лонджано остаются верными Римини. В 1198 году замок был атакован и разрушен чезенатами, но уже в следующем году риминэзи восстанавливают его. Прошло немного лет и чезенаты вновь осадили замок, но были на этот раз отбиты и изгнаны. В 1297 году чезенатам удалось отомстить - они сумели поджечь Лонджано. В 1387 году лонджанцы воюют с Орделаффисом, хозяином Форли, а в 1424 году происходит столкновение с армией герцога Милана. В 1429 году в замке Лонджано умер Карло Малатеста, стратег, кондотьер и просвещенный правитель.
В 1463 году Лонджано перешел под непосредственный контроль Папского государства и оставался там почти непрерывно в течение 400 лет, до 1859 года.
